《阿凡达2》的剧情承接自初代的5年之后。曾经的地球残疾军人杰克·萨利，如今已经是潘多拉星球纳美族一方部族的族长，并且与爱妻娜塔莉共同育有一对可爱的儿女，日子过得平淡而充实。一个清冷的雨夜，杰克忽然回想起他过去的人类生活，那些来到潘多拉之前的日日夜夜。那个时候的地球，生态环境已经因为人类的种种破坏而濒临崩溃，各种大小天灾接连不断，必须依靠去外星强取豪夺各类资源才能勉强维持生存，而潘多拉星球的宝贵矿产和自然资源，也许是能够挽救地球的重要力量，更是他们觊觎已久的对象。此时的杰克心里十分清楚，想要人类放弃征服潘多拉的计划是不可能的，必须随时保持高度的警惕。就在这时，有手下人跑来告诉他，有个部族的兄弟在海岸附近巡逻时遭到利器割喉身亡。通过现场勘查，以及作为前海军陆战队员的敏锐直觉，杰克判断已经有人类的阿凡达混入了部落。